Debes comunicarlo al SEPE para que te suspendan la demanda de empleo, por lo demás seguirás cobrando el subsidio como hasta ahora.
Esto es lo que dice el SEPE en su página:
"Aunque te encuentres enfermo o enferma, la cuantía del subsidio que estés percibiendo no varía; tampoco su duración. Si durante la percepción del subsidio, debido a enfermedad o accidente, te encontraras imposibilitado o imposibilitada temporalmente para trabajar, deberás entregar en la oficina de empleo el justificante médico en el que conste dicha circunstancia.
Deberás contactar con tu Oficina de Empleo para informarles de esta situación de IT.
Al finalizar el subsidio no tendrás derecho a prestación económica por incapacidad temporal aunque continúes enfermo o enferma, ya que no te encuentras en situación de alta o asimilada al alta en la Seguridad Social para esta prestación."
Un saludo