Sujeto a ITP o IVA

Supongamos que como particular compro un bien a una sociedad mercantil.

Ambos consideramos que la operación está sujeta a ITP y procedo a pagar dicho impuesto.

Pasado un tiempo la Agencia Tributaria dice que naranjas de la china y que quiere su pasta.

¿Puede la sociedad reclamarme ese IVA o puedo decirle que haber estudiao y a mí qué me cuenta?

Podrías decirle lo segundo, aunque con palabras más amables, en base al art. 89.Tres.1º de la Ley de IVA.
Para ayudar al proveedor, podrías facilitarle copia de tu declaración del ITP.