Seguimiento diario del Coronavirus

https://www.kitradio.net/reportaje-de-donde-salio-el-coronavirus-toda-la-verdad/

Pooka, yo estoy muy a favor del debate científico y me parece saludable que la gente tenga otras opiniones y las defienda. Yo prefiero que alguien me muestre que estoy equivocado a seguir estándolo.

1. Esto probablemente lo sepas, pero otros no. La neumonía es una enfermedad muy común que responde a numerosas causas, la mayoría son de origen infeccioso, pero no todas (las hay de origen químico o tóxico). Los médicos distinguen las neumonías intrahospitalarias (nosocomiales), que suelen ser muy graves porque el paciente ya está hospitalizado por otras causas y porque los patógenos suelen ser peligrosos y resistentes, y las extrahospitalarias.

Las neumonías extrahospitalarias, que son las que nos ocupan pueden ser causadas por hongos, bacterias o virus. Las de hongos son menos frecuentes y afectan sobre todo a pacientes inmunocomprometidos. Las neumonías virales son causadas principalmente por el virus de la influenza, virus sincitial respiratorio, y el adenovirus. De estas la más grave suele ser la primera. El VSR afecta casi solo a niños. Las neumonías bacterianas pueden ser debidas a numerosas bacterias, aunque en la mayoría de los casos se deben a Streptococcus pneumoniae. Cuando el agente que causa la neumonía es infrecuente, la neumonía se denomina atípica. El agente tóxico en la crisis del aceite de colza causaba neumonía calificada como atípica.

El agente infeccioso de las neumonías se determina solo en un porcentaje entre el 20-50% de los casos, el resto son neumonías de origen desconocido, pero los médicos suelen saber si son de origen bacteriano o vírico porque tratan a los pacientes con antibióticos y porque las neumonías pueden presentar imágenes específicas en las radiografías y TACs. Por eso cuando de pronto empiezan a aparecer neumonías de origen desconocido y frecuente desenlace fatal las alertas saltan en seguida. En Wuhan eso empezó a pasar a mediados de noviembre y a mediados de diciembre ya sabían que tenían una nueva enfermedad entre manos.

Las muertes por neumonía en España eran predecibles. Las muertes por neumonía causada por coronavirus son además de, no en lugar de. En España hay 3800 camas de UCI que normalmente están ocupadas al 80%. Una vez que tienes más de 800 casos de coronavirus que requieren cama de UCI empieza a haber gente que requiere UCI y no la obtiene. Puesto que el 5-10% de los casos requieren cama de UCI, con más de 10.000 casos ya estamos al límite de camas de UCI.

2. Ese artículo no dice lo que tú crees que dice. Lo que dice es que cuando tienes un grupo de personas que son contactos estrechos de alguien que ha dado positivo (por ejemplo familia que viven juntos) el número de falsos positivos se dispara. Hasta el perro, que no puede pasar la enfermedad da positivo. La clave está en "In the close contacts of COVID-19 patients". Esto tiene una explicación muy sencilla. El test es muy sensible y las personas infectadas esparcen partículas de virus por todas partes y el test las detecta aunque el virus esté muerto (inactivado). Estará presente en la piel y en la saliva de casi todas las personas en estrecho contacto con alguien infectado. Si pasan o no la enfermedad sin síntomas solo podría saberse con un test de anticuerpos, que es más caro y no se suele hacer. Pero si te vas a un sitio donde la enfermedad no haya llegado (mi casa, por ejemplo), la probabilidad de un falso positivo es muy baja y basta repetir el test para que el falso positivo no se reproduzca.

3. La neumonía por coronavirus es distinta a las demás neumonías. La gente que la padece tiene una neumonía vírica que no es debida al virus influenza y que presenta unas imagenes en radiografías y TACs que son distintas, con formaciones que se describen como opacidades y cristal esmerilado:
"Los hallazgos típicos de la TAC incluyeron cristal esmerilado del parénquima pulmonar bilateral y opacidades pulmonares consolidadas, a veces con una morfología redondeada y una distribución pulmonar periférica. En particular, la cavitación pulmonar, nódulos pulmonares discretos, derrames pleurales y linfadenopatía estaban ausentes."
https://pubs.rsna.org/doi/10.1148/radiol.2020200230

Los doctores sabían que era una neumonía distinta antes de que se secuenciara el virus y se desarrollara el test porque sus características eran distintas. De hecho se hizo esto porque se sabía que había un nuevo agente causando neumonía y se buscó. El que se encontró fue el COVID19. Guilty as charged.

4. Son buenas noticias que la respuesta inmunológica sea como la de la gripe, porque eso permite desarrollar vacunas. Contra algunos coronavirus la inmunidad desaparece en 8 meses. En ciencia nada se puede descartar con absoluta certeza, pero yo sí estoy muy seguro que la identificación del COVID19 es correcta. Con medio mundo haciendo tests por doquier y tratando enfermos, si no lo fuera habría médicos y científicos manifestando dudas por todas partes.

Lo primero de todo gracias por responderme con tus comentarios Know; quiero creer que soy razonable y que por lo tanto soy consciente que las percepciones de los seres humanos van contra los datos numéricos y empíricos la mayor parte de las veces....así que como científico que soy (aunque en un área muy diferente a la medicina) pongo los siguientes datos para tu consideración/reflexión:

1.- https://es.statista.com/estadisticas/591465/numero-de-muertes-por-neumonia-en-espana/
Aquí estamos constatando que en 2017 murieron un promedio de 852 personas AL MES en España por neumonía (10.222 en total). ¿Alguien recuerda en ese año episodios/noticas de escasez masiva de camas UCI y de ventiladores por tal motivo?

2.- https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32133832/?fbclid=IwAR3LHLplRtmPZED3jt_Hjf2ZKysmDcXMU5LgVgNPcqNAtb9EzcQBKMtCIoI

Aquí estamos constatando que (y transcribo literalmente del artículo científico de PubMed.gov):
" RESULTS: When the infection rate of the close contacts and the sensitivity and specificity of reported results were taken as the point estimates, the positive predictive value of the active screening was only 19.67%, in contrast, the false-positive rate of positive results was 80.33%. The multivariate-probabilistic sensitivity analysis results supported the base-case findings, with a 75% probability for the false-positive rate of positive results over 47%. Conclusions: In the close contacts of COVID-19 patients, nearly half or even more of the 'asymptomatic infected individuals' reported in the active nucleic acid test screening might be false positives."

Por ello, es perfectamente plausible utilizar este test en poblaciones donde la pandemia no ha llegado (según dices tú en el punto 1 de tu respuesta)y hallar que SÍ esta presente.

3.- Analizando tu punto 2: "mucha gente que tiene el virus acaba desarrollando la enfermedad", si nos referimos por enfermedad a la neumonía entonces me remito a la comparación numérica con las tasas reportadas en 2017 (cuando no estaba supuestamente el covid19 en este mundo) que nos deja un ratio mensual de 850 personas!!. Adicionalmente con tu afirmación "todos los que desarrollan la enfermedad tienen el virus", asumiendo la veracidad del test PCM y sus falsos positivos/negativos eso puede ser cierto, pero por sí solo no acredita la causa única ya que en una neumonía pueden coexistir múltiples infecciones bacterianas y víricas. Finalizando con tu afirmación "los que no tienen el virus no desarrollan la enfermedad" pues no fue la situación de los 10.222 personas del año 2017.

4.- Por último, tu afirmación del punto 3 de tu mensaje: totalmente de acuerdo con ella, de hecho un equipo de investigadores del Instituto de Infección e Inmunidad Peter Doherty, de la Universidad de Melbourne, afirma que la reacción del sistema inmunológico contra el COVID-19 es similar a la que tiene contra la gripe (https://www.nature.com/articles/s41591-020-0819-2). Pero ¿estamos en disposición de aseverar y demostrar con números y datos científicos que covid19 es el autentico catalizador/origen de todas las muertes que se estan reportando por neumonía?

En fin, perdon por la longitud del mensaje, escrito sin animo alguno de polemizar (las posiciones totalmente contrarias a la postura mayoritaria no son necesariamente irracionales...recordemos a Galileo, Copernico, Newton...) sino al contrario para contribuir al necesario debate racional y científico sobre este suceso tan importante.

Gracias y un saludo.

La página de estadísticas del SACYL:

https://analisis.datosabiertos.jcyl.es/pages/coronavirus/

En UCI hay aproximadamente un 10% de los casos activos.

Pooka,

Esas estadísticas que mencionas supongo que las podrá conseguir quien las solicite y sea investigador o quizás periodista. Yo no sé si se hacen públicas en algún lado, aunque puede que estén reflejadas en artículos científicos especializados. España no es un país muy dado a poner información en la red como EEUU.

La liberación de este coronavirus en la especie humana conlleva una rápida propagación local y una multiplicación de casos de neumonía y un aumento significativo de muertes por neumonía. Allá donde se ha dado esto es donde ha surgido el virus, es decir en Wuhan (Hubei, China). Es imposible que lleve tiempo circulando entre nosotros sin haber sido descubierto por sus obvios efectos, y de haber surgido en otra parte se hubiera extendido desde esa otra parte y no desde Wuhan.

La certeza de que el COVID19 es el causante de la pandemia es altísima porque:
1. Es un virus nuevo que se aisla y por tanto está presente en pacientes de todo el mundo, pero no en poblaciones donde la pandemia no ha llegado.
2. La presencia del virus está asociada al desarrollo de la enfermedad, es decir mucha gente que tiene el virus acaba desarrollando la enfermedad, todos los que desarrollan la enfermedad tienen el virus y los que no tienen el virus no desarrollan la enfermedad.
3. Es un coronavirus, que sabemos que tienen la capacidad de causar este tipo de enfermedades en humanos, como el SARS.

Ese tipo de dudas, a estas alturas, no son razonables, pero vamos a escuchar de todo.

Gracias!

Pues fíjate que hemos pasado hasta a Irán en número de bajas. 157 muertos van hoy. Tremendo

Ya no hacen la Prueba a nadie más que a sanitarios o casos graves. Con eso que van a conseguir que gente que no sabe que esta infectada siga extendiendo el virus. Lo suyo es hacer las máximas pruebas y cuando salga positivo seguir y seguir con sus contactos. La gestión actual es un Grave error. Vaya gestión desastrosa de nuestros políticos.

Para que te hagan caso en el SACYL (que no sé si harán la prueba o directamente te ponen como positivo, creo que solo la hacen a los que mandan al hospital) es tener tos y más de 38 de fiebre.

Eso si consigues contactar, porque al menos desde el domingo la línea está saturada (un amigo está intentándolo pero aún no ha conseguido que le cojan el teléfono). Se pide que se contacte con el médico de cabecera para no saturar la línea (han dado incluso un número de fax... ¿pero quién cojones tiene fax en casa?).

Los datos de casos en España (gráfica 3, curva negra) llevan siendo raros un par de días. Probablemente el sábado 14, pero definitivamente el domingo y lunes 15 y 16 los casos han sido excesivamente bajos para la fase de crecimiento en la que estamos.

Hoy Fernando Simón en su comparecencia diária ha reconocido que carecen de la capacidad para realizar todos los tests que deberían estar haciendo si siguieran las recomendaciones de la OMS. El día 11 se cambió el criterio para testar solamente a las personas con síntomas serios. Todo ello hace que el número de casos se subestime significativamente y la tasa de mortalidad se dispare. También empeora la evolución general de la epidemia porque no se toman medidas para que las personas que no son diagnosticadas pero darían positivo si lo fueran sean aisladas. Digamos que es la estrategia opuesta a la de Corea del Sur que yo ya opiné que aquí era inviable.

Los datos de muertes, aunque presentan oscilaciones mucho mayores por ser un número mucho más bajo, van a ser la forma de seguir la enfermedad en España.

Hola Know, ¿se puede verificar mediante las estadísticas disponibles en las bases de datos españolas y europeas, la diferencia absoluta entre los casos reportados de enfermos con síndrome respiratorio agudo grave ( y también de los enfermos de neumonía) durante los tres primeros meses de este año frente a los años anteriores (2018, 2017, 2016...).

Y por otra parte, y dado que Albert Bosch, virólogo y Presidente de la Sociedad Española de Virología afirma que el SARS-CoV-2 "probablemente hace tiempo que circula entre nosotros" porque "hay una proporción demasiado elevada de casos asintomáticos como para ser un virus reciente" y que se ha estimado en diversos estudios científicos que estamos en simbiosis con una cantidad ingente de virus y bacterias (https://www.nacion.com/ciencia/aplicaciones-cientificas/en-nuestro-cuerpo-viven-unos-48-billones-de-bacterias-60-billones-de-virus-y-varios-miles-de-millones-de-hongos/ZBPGABKRE5AZLJUVGTHZ2GMP4Q/story/), ¿existe evidencia científica más allá de toda duda de que el virus covid19 es el causante/autor indiscutido de las muertes reportadas en los fallecidos con morbilidad previa y por síndrome respiratorio agudo grave y/o neumonía?

Lo digo por la duda razonable sobre si pudieramos estar colgando la etiqueta de "homicida" al covid19 sin respetar la debida "presunción de inocencia"...utilizando un proceso de detección post-mortem con una prueba de test PCM que tiene un acierto variable (en torno al 70%) y en un proceso de detección pre-mortem con los mismos mimbres...

¿qué opinas al respecto?.

Gracias y un saludo.

Ahora que comentas lo del cierre de fronteras, hay cierto usuario que antes se pasaba con mucha asiduidad y cuyos pronósticos se han ido incumpliendo uno a uno. Supongo que su ausencia vendrá motivada por ello...
La confrontación de ideas me encanta, pero sus aportaciones hacia tiempo que habían dejado de enriquecer el debate.

La medida que yo defendí era el cierre de la frontera a personas, no a mercancías, y es obvio que si se puede cerrar a los extranjeros se puede cerrar a todo el mundo. Creo que es trivial movilizar los recursos para internar durante 15 días a todo el que quiera entrar. No es muy distinto a lo que se hace con los refugiados que llegan a algunos países como Grecia, y se pueden utilizar hoteles, residencias, etc, o campamentos construidos por el ejército donde no haya suficientes plazas.

Lo que no me queda claro es la utilidad de la medida a estas alturas. ¿Acaso piensan que la van a erradicar en España y hay que evitar que vengan más casos de fuera? Si es así son de un optimismo desaforado. Las medidas tomadas son eficaces para reducir la velocidad de propagación. Para erradicar necesitas cortar todos los contactos durante 40 días.

Pelayo…, la tasa de mortalidad depende de multitud de factores:
- Edad de la población
- Genética de la población
- virulencia de la subpoblación de virus
- Eficiencia del sistema sanitario (modernidad)
- Grado de saturación del sistema sanitario
- Nivel de detección de los casos asintomáticos, leves y moderados

En el caso de la gripe de 1918 la mortalidad por países varió muchísimo entre otras cosas porque el virus fue cambiando a una forma menos letal. Con un virus RNA la población que tienes al día de ser infectado es ligeramente distinta a la que tienes a los siete días de ser infectado, cada paciente realiza una pequeña selección, y cuando el número de pacientes es muy alto aparecen con frecuencia cambios más importantes y las distintas variedades de virus, con distinta virulencia, compiten entre sí para ver cual se extiende con mayor eficiencia.

Al final se podrá estimar una tasa global de mortalidad para el COVID19 en su ola pandémica de 2020, que yo estimo en torno al 1%, sobre la que los expertos discutirán sin cesar en la literatura, porque la calcularán con distintos métodos y llegarán a distintas conclusiones.

Pero es obvio que cuanto mayor sea tu población, más eficiente fuera tu sistema de salud para mantener con vida a la gente con otras patologías antes de la epidemia, menos tests hagas a la gente que no tiene síntomas graves, y más saturado se vea tu sistema de salud, mayor va a ser tu tasa de mortalidad. Nuestra tasa de mortalidad va a ser muy alta.

También discutí con Valentin el tema de la baja mortalidad en Alemania. La gente que muere de COVID19 lo hace casi siempre de síndrome respiratorio agudo grave, que es una patología con una mortalidad muy alta. Desde 2006 ha habido avances importantes es su tratamiento, como ventilación forzada de bajo flujo con el paciente paralizado y en posición prona, pero si en la UCI que te tratan no están muy al día en las nuevas técnicas tus posibilidades se reducen significativamente (~ 33%). Son cosas que podrían explicar que países con una sanidad mejor que no está desbordada tengan una mortalidad menor.

No sé donde se pueden conseguir los fallecimientos por tramo de edad en España, no los he visto, creo que no se hacen públicos.

La K y la c de Gompertz cambian con las medidas y eso hace que la curva de datos se modifique y no siga tan bien la función de Gompertz, sin embargo cuando se alcanza el máximo de casos o muertes diarios el valor de la K ya proporciona un valor y el final no debería estar muy alejado a no ser que se relajen las medidas con lo cual habría una segunda función de Gompertz sobre la primera. Si miras los datos mundiales puedes ver que en febrero se seguía una función de Gompertz debido a los casos de China, pero en marzo sigue otra al haberse añadido los casos mundiales. Algo así es lo que se vería si se relajan las medidas y el virus vuelve a extenderse.

Para comparar entre países creo que es más fiable usar los datos de muertes, que son más homogéneos. Así se explica la diferente situación, por ejemplo, entre España y Alemania. Si miras el número de casos, estamos en una situación similar (únicamente les llevaríamos un par de días de ventaja). Pero viendo el número de muertos, se ve que les llevamos mucha más ventaja.

Si contabilizas como casos positivos todos los casos leves o asintomáticos, la letalidad así calculada te sale mucho menor.

Y no parece a priori que se deba a otros factores, como que la dieta mediterránea es peor o la pirámide de población sea muy diferente.

Simplemente en unos países se prueba más y por eso se detectan más casos. Y en otros ninguno, como en Libia o Siria, que tienen otras preocupaciones (o menos medios), pero aunque no salgan en el mapa no quiere decir que sean inmunes.

Bueno, cierre, cierre... a los peluqueros les dejan pasar. ;)

Que se centralice la información en el Gobierno no me da ninguna confianza, sobretodo después de demostrar que no nos informan de toda la verda y nos tratan como si fuesemos una sociedad poco inteligente.

Hola

España no cierra sus fronteras. Permiten el paso a cualquier español o residente, además de transportistas, ect.

Lo que se dijo que era medida imposible de tomar era el cierre total, es decir, un español de vacaciones fuera del país no podría volver, los camiones con mercancia tampoco, ect.

Un saludo y gracias por el Blog

Saludos,
por fin he sacado tiempo para montar mi excel y quisiera conocer vuestras impresiones sobre alguna correlación que voy ordeñando, me gustaría conocer las opiniones sobre esto (y sus relaciones con "gompertz")
a) El día 13 los casos activos en Italia superaron los casos activos en China. Ello sin ponderar los casos activos por población...
b) Si el día 16 había 3216 fallecidos en China, y 2747 en Italia, al ritmo que van Italia, habrá más fallecidos en Itala que en China el día 18
C) La letalidad (fallecidos/contagiados) a nivel mundial ha pasado de 3.6% a 3.9% en los ultimos siete dias. La de China de 3.9% a 4.0%. La de Italia, de 5% a 7.7%. En Alemania continua estable en 0,2%. Francia, de 1.8 a 2.3. En España, de 2.3?? a 3.6. La letalidad cuando se tienen 1500 infectados ronda el 2.2 a 2.4, tanto en UK, US, España, Francia e Italia. No se si tiene que ver con la curva de gompertz, pero pienso que cada pais debe tener una pirámide de poblacion diferente y algo influirá en la letalidad.
d) ¿Que tiene Italia para estar tan disparada? ¿es cuestion de poblacion envejecida y/o poco sana? o es lo que vaticina gompertz ... ¿iremos todos por ahí
d) Alemania... ¿es que no tiene poblacion de riesgo o es que tienen un remedio secreto que no cuentan? ¿o trucan las cifras? Italia con aprox 7000 contagios tenia 300 fallecidos, y Alemania, 60... lo de gompertz parece que difieren las constantes por pais, luego lo de igual letalidad a los 1500 por ser asi la curva parece poco solido...
e) En España... ¿porqué la letalidad va en aumento?
f) ¿alguien sabe donde pueden conseguirse cifras de fallecimientos por Covid-19 por tramo de edad en España y los otros paises? ¿y de porcentaje de ploblacion por tramo de edad?
g) ¿como influyen los aislamientos en la funcion de gompertz? supongo que cuando cambian las condiciones hay que reajustar las constantes...
Gracias!

El gobierno ha decidido usar sus poderes para controlar la información, y se ha acabado el que las comunidades comuniquen sus casos. El gobierno proporcionará la cifra de casos y muertos todas las tardes. Eso afecta al dato de hoy que no corresponde a un periodo de 24 h sino de 16 h.

Aún así la previsión para hoy (16 de marzo) de 10080-11184 casos ha andado muy cerca, a 138 casos de la horquilla inferior. Hoy han sido 9942 casos con 1942 casos nuevos y 49 fallecidos nuevos.

La previsión para mañana es que los casos aumenten en 2421-3870, para un total de 12363-13812 casos.

Entre los cambios en la forma de comunicar los datos y los cambios en el criterio para realizar los tests, se hace más difícil analizar con rigor la evolución de la epidemia.

España cierra sus fronteras. Esta medida generó gran discusión en los comentarios a mis artículos cuando la defendí como la única razonable para mantener al virus fuera de España. Se me dijo que era una medida imposible de tomar. Bien, esto demuestra que no lo era. Viviríamos una realidad muy diferente y mucho más favorable si las fronteras se hubieran cerrado hace 4 ó 5 semanas y se hubieran activado mecanismos de detección temprana.