¿Aportacion onerosa a gananciales o donación? He aquí la cuestión

Buenos dias. Mi mujer posee una vivienda privativa que prácticamente hemos pagado entre ambos y queríamos incluirla en el régimen de gananciales para que también fuera de mi propiedad digamos. En mi comunidad el impuesto de donaciones lo han suprimido y me surge la duda de que sería mejor en este caso, si una aportación onerosa al regimen de gananciales o directamente una donación del 50%.

Aportación gratuita  a la sociedad de gananciales, ni ISD, ni ITP. Salvo mejor opinión. 
https://www.poderjudicial.es/search/AN/openDocument/8b35cb2891f11750/20210329

Pero entiendo que con el impuesto de donaciones tampoco se paga nada, por eso no sé cual sería la diferencia mas sustancial

En primer lugar, ten en cuenta que no pagar nada por Donaciones no quiere decir que el Impuesto se haya suprimido. El Impuesto existe y seguro que es obligatorio presentar declaración.
Por otro lado, es probable que tu mujer tenga que tributar en el IRPF por la ganancia patrimonial. Con la otra alternativa no sé si habría tal, es posible que no, pero no lo aseguro porque hablo de memoria.

Gracias. Lo consultaré mas detenidamente con un notario.

Si te dona a ti el 50% hay transmisión y por tanto habrá plusvalía, ISD (con independencia de que pueda quedas exento) e IRPF por la ganancia patrimonial de tu mujer como diferencia entre el 50% del precio de compra y el valor de ese 50% a precio de mercado.
Si dona a título gratuito el 100% a la sociedad de gananciales, no hay transmisión puesto que sigue siendo propietaria del 100% y si no hay transmisión no puede haber ganancia patrimonial. 
Salvo mejor opinión. 

Cierto, no había caído en ese impuesto de las donaciones. 
En cualquier caso, es incluso menor, así que no habría problema