Itp vs Irpf

Buenas tardes,
Cuando compre mi vivienda  habitual en el 2012 el banco me impuso pagar el ITP en función del valor de tasación y no el real de compra. Había una diferencia de 50.000€ por lo que pague casi 4000€ más.

Ahora vendido la casa con beneficios con respecto al valor de compra pero pérdidas con respecto al valor de tasación... ¿Debo pagar IRPF?

Gracias de antemano. Saludos

Si.
El ITP se devenga sobre "el mayor de" precio real o valor real. Como el valor (tasación) era superior al precio, el ITP se hizo, correctamente, sobre el valor.

El IRPF ganancia patrimonial se devenga sobre "la mayor ganancia" entre importe o valor de transmisión vs. importe o valor de adquisición.
Como supongo que no has vendido con descuento, la cuantía mayor es la diferencia entre Venta real - Compra real

Son impuestos diferentes, que usan normas diferentes, pero como cualquier impuesto, su intención es recaudar lo más posible.