Como dice Alfonso, cuantos más años puedas tener en cuenta en tu análisis mejor, porque no hay mayor dato manipulable como el beneficio.
Aunque, pueda parecer que total beneficio es ingresos menos gastos, hay muchas formas de poderlo hacer mayor o menor, por ejemplo, las amortizaciones que pueden llevar a ganar mucho más dinero a una empresa dependiendo del sistema de amortización que le interese para ejercicio.
Por ejemplo, una empresa que quiera lanzar una ampliación de capital va intentar "manipular" su beneficio para que en los dos últimos años sea mucho mayor, siempre de forma legal, claro está. Para ello puede, por ejemplo, utilizar una base mayor de amortización para reducir impuestos y obtener un mayor beneficio neto.
Así que hay que ir con mucho cuidado con el beneficio, y esa es una "desventaja" del análisis fundamental, que no es un termino exacto y depende de muchos factores.