Implementación de E-Factura en tu sistema de contabilidad.

Hola a todo el mundo. Tengo un sistema de contabilidad con una base de datos echa por mi. Ahora que nos estamos a acercando a la obligatoriedad de la factura electrónica, me surgieren algunas dudas. He visto que en el portal de la Agencia tributaria te puedes descargar el programa de factura electrónica. Pero alguien sabe como podría introducirla o como conectaría este programa con mi base de datos, para no tener que copiar  y pegar todo los campos de mis clientes? He buscado por todas partes , pero nadie  me ha podido solventar esta duda. He pensado que en este foro hay mas de un autónomo, que no tiene un programa comprado y actualizado a las ultimas. Gracias