Es, ni más ni menos, que un tema de negociación bancaria. El BdE lo tendrá como "comisión aceptada", es decir, que se puede cobrar por ella. De hecho, hay transferencias en las que ya se cobra (OMF, extranjero y similares).
Todo es cuestión del negocio que generéis a vuestro banco y vuestro poder de negociación.
Si trabajáis mucho con la entidad, no creo que haya problema es suprimirla. El roce vendrá si es una entidad en la que no movéis mucho dinero, será más difícil.
Saludos.
España