Anotar el precio de alquiler viviendo de alquiler.

    Estoy  viendo  que  en   las  deducciones  de  la  Comunidad  de  Madrid, hay una  deducción  por   pagar  alquiler de  la  vvienda  habitual;  cuando  lo  relleno,  veo  que  esto  no  tiene  ninguna  deducción,  es más  pone  que  los  resultados  se verán  reflejados  en  la  casilla 1130, y  en  esa casilla no se  refleja nada.  Pone  también  que  si  se gana más de  60000 euros,  no  se  aplicaría  deducción,  pero  no  es  el  caso.

 Por que   no aplican  esa  deducción?
  Gracias

El propio término te lo explica: es una deducción; es decir: hay una cuota tributaria autonómica y, si cumples los requisitos especificados en la normativa autonómica, te deducen un dinero de esa cuota.
En tu caso, la cuota autonómica es 0. Es decir: lo que tienes que pagar a la Comunidad de Madrid de tu IRPF es 0. Por tanto, puedes aplicar todas las deducciones que quieras, pero, si ya pagas 0, seguirás pagando 0. No se puede deducir nada más, si ya antes no pagas nada de IRPF autonómico. 
Las deducciones no sirven para "regalar" dinero; sirven para pagar menos. Si tú tenías que pagar 2000, con la deducción a lo mejor sólo tienes que pagar 1000. Pero, si tú no tenías que pagar nada, pues sigues sin pagar nada.