Error en la numeración de las facturas emitidas

Hola Rankianos, he aquí el asunto:
ANTECEDENTES: 

En mis datos fiscales aparece la cantidad declarada por uno de mis clientes. Y difiere de la que declaré en su momento debido a una factura que no debí haber emitido. Se trata de una factura de 121 euros con una cuota de IVA de 21 euros. 
He solicitado a Hacienda una devolución de ingresos indebidos por los 21 euros pagados de más. Y voy a proceder a presentar nuevamente el resumen anual del IVA. 
PROBLEMA:

Queda un hueco en la numeración de las facturas por aquella eliminada. Y sé por experiencia que en caso de requerimiento de Hacienda del libro de registro de facturas imponen sanción de 150 euros por cada factura mal numerada. 
PREGUNTA:

Cómo debería solucionar este problema? Sé que puedo emitir nuevamente las facturas renumerandolas y hacerlas llegar a mis clientes. Pero no es la primera vez que me pasa esto y sé por experiencia que podrían negarse a aceptarlas al ser un ejercicio ya cerrado. 
Gracias